Population genetics and molecular identification of Crocodylus acutus and C. moreletii (Crocodilia: Crocodylidae) in captive and wildlife populations / Genética de poblaciones e identificación molecular de Crocodylus acutus y C. moreletii (Crocodilia: Crocodylidae) en poblaciones de cautiverio y de vida libre

Abstract Introduction: There is low evidence of genetic diversity and hybridization processes within Crocodylus acutus and C. moreletii populations. Objetive: To evaluate genetic diversity and some phylogenetic relationships in wild and captive populations of C. acutus and C. moreletii using the Barcode of Life Data System (COX1, cytochrome C oxidase subunit 1 gene). Methods: 28 individuals phenotypically like C. acutus located in the state of Guerrero, Oaxaca and Quintana Roo were sampled, as well as animals belonging to C. moreletii located in the states of Tabasco, Campeche, and Quintana Roo. 641 base pairs of nucleotide sequence from COX1 were used to obtain the haplotype and nucleotide diversity per population, and a phylogenetic and network analysis was performed. Results: Evidence of hybridization was found by observing C. moreletti haplotypes in animals phenotypically determined as C. acutus, as well as C. acutus haplotypes in animals classified as C. moreletti. Low haplotypic diversity was observed for C. acutus (0.455 ± 0.123) and for C. moreletii (0.505 ± 0.158). A phylogenetic tree was obtained in which the sequences of C. acutus and C. moreletii were grouped into two well-defined clades. Organisms identified phenotypically as C. acutus but with C. moreletii genes were separated into a different clade within the clade of C. moreletii. Conclusions: There are reproductive individuals with haplotypes different from those of the species. This study provides a small but significant advance in the genetic knowledge of both crocodile species and the use of mitochondrial markers, which in this case, the COX1 gene allowed the detection of hybrid organisms in wild and captive populations. Conservation efforts for both species of crocodiles should prevent the crossing of both threatened species and should require the genetic identification of pure populations, to design effective conservation strategies considering the possibility of natural hybridization in areas of sympatry.

Resumen Introducción: Existe poca evidencia de la diversidad genética y los procesos de hibridación dentro de las poblaciones de Crocodylus acutus y C. moreletii. Objetivo: Evaluar la diversidad genética y algunas relaciones filogenéticas en poblaciones silvestres y cautivas de C. acutus y C. moreletii utilizando el Sistema de Código de Barras de la vida (COX1, subunidad I del gen del citocromo C oxidasa). Métodos: Se muestrearon 28 individuos fenotípicamente similares a C. acutus ubicados en los estados de Guerrero, Oaxaca y Quintana Roo, así como animales pertenecientes a C. moreletii ubicados en los estados de Tabasco, Campeche y Quintana Roo. Se utilizaron 641 pares de bases de la secuencia de nucleótidos de la subunidad I del gen del citocromo C oxidasa para obtener el haplotipo y la diversidad de nucleótidos por población, y se realizó un análisis filogenético y de redes. Resultados: Se encontró evidencia de hibridación al observar haplotipos de C. moreletti en animales determinados fenotípicamente como C. acutus, así como haplotipos de C. acutus en animales clasificados como C. moreletti. Se observó una baja diversidad haplotípica para C. acutus (0.455 ± 0.123) y para C. moreletii (0.505 ± 0.158). Se obtuvo un árbol filogenético en el que las secuencias propias de C. acutus y C. moreletii se agruparon en dos grandes y bien definidos clados. Los organismos identificados fenotípicamente como C. acutus pero con genes de C. moreletii se separaron en un clado diferente dentro del clado de C. moreletii. Conclusiones: Existen individuos reproductores con haplotipos diferentes a los de la especie. Este estudio aporta un pequeño pero significativo avance en el conocimiento genético tanto de las especies de cocodrilos como del uso de marcadores mitocondriales, que, en este caso, el gen COX1 permitió la detección de organismos híbridos en poblaciones silvestres y cautivas. Los esfuerzos de conservación para ambas especies de cocodrilos deben evitar el cruce de ambas especies amenazadas y deben requerir la identificación genética de poblaciones puras, para diseñar estrategias de conservación efectivas considerando la posibilidad de hibridación natural en áreas de simpatría.

Caracterización de la curva de crecimiento en dos especies de pez blanco Chirostoma estor, C. promelas y sus híbridos / Characterization of the growth curve in two species of silverside Chirostoma estor, C. promelas and their hybrids

The objective of the present study was to estímate growth curve parameters of length and weight in whitefish Chirostoma estor (EE), blacknose silverside Chirostoma promelas (PP) and their reciprocal hybrids (EP and PE) up to 300 days of age from a complete diallel cross under culture conditions in Morelia, Michoacan, Mexico. The length was measured monthly from hatching, while the weight was measured monthly from 120 days of age. The total number of each observation (samples) was analyzed for length 1006 (26), 771 (22), 513 (22) and 421 (21) for groups EP, PE, PP and EE, respectively. Total number of observations (samples) was analyzed for weight 630 (16), 521 (14), 263 (13) and 256 (13) for groups EP, PE, PP and EE, respectively. The growth curves for weight and length were estimated using nonlinear regression models. The group EE reached an estimated weight of 7.89 g at 300 days of age, 65% higher than the PP (4.78 g) and 57 % higher than the average of their hybrids (P < 0.01); EE had a length of 9.31 cm (14%) larger than PP (7.97 cm) and 13% larger than the average of their hybrids (P < 0.01). The four groups showed a positive allometric growth with values of 3.20 to 3.3 (P < 0.05). The results of this study are the first comparative estimates of growth characteristics up to 300 days of age for these species and their hybrids in captivity.

El objetivo del presente estudio fue estimar parámetros de las curvas de crecimiento del peso y la longitud en el pez blanco Chirostoma estor (EE), el pez blanco pico negro Chirostoma promelas (PP) y de sus híbridos recíprocos (EP y PE) hasta los 300 días de edad a partir de un cruzamiento dialélico completo bajo condiciones de cultivo en Morelia, Michoacán, México. La longitud se midió mensualmente desde la eclosión, mientras que el peso se midió mensualmente a partir de los 120 días. Los números totales de observaciones (muestras) analizadas para longitud fueron 1006 (26), 771 (22), 513 (22) y 421 (21) para los grupos EP, PE, PP y EE, respectivamente. Los números totales de observaciones (muestras) analizadas para peso fueron 630 (16), 521 (14), 263 (13) y 256 (13) para los grupos EP, PE, PP y EE, respectivamente. Las curvas de crecimiento para peso y longitud se estimaron con modelos de regresión no lineal. El grupo EE alcanzó un peso estimado de 7.89 g a los 300 días de edad, 65% mayor que el de PP (4.78 g) y 57% mayor que el promedio de los híbridos (P < 0.01); EE tuvo una longitud de 9.31 cm (14%) mayor que PP (7.97 cm) y 13% mayor que la del promedio de los híbridos (P < 0.01). Los cuatro grupos, mostraron un crecimiento de tipo alométrico positivo con valores de 3.2 a 3.3 (P < 0.05). Los resultados de este estudio son las primeras estimaciones comparativas de las características de crecimiento hasta los 300 días de edad para estas especies y sus híbridos en cautiverio.

Polymorphism of locus DRB3.2 in populations of Creole Cattle from Northern Mexico

The polymorphism of locus BoLA-DRB3.2 of the Major Histocompatibility Complex was evaluated in two northern Mexican Creole cattle populations, Chihuahua (n = 47) and Tamaulipas (n = 51). The BoLA-DRB3.2 locus was typed by amplification and digestion with restriction endonuclease enzymes (PCR-RFLP). Fifty-two alleles were detected (28 previously reported and 24 new ones). In the Chihuahua population, 18 alleles and 5.5 effective alleles were found, while in the Tamaulipas population there were 34 and 10.8, respectively. The allele frequencies ranged from 0.011 to 0.383 in Chihuahua and from 0.010 to 0.206 in Tamaulipas. The frequencies of the new alleles in both cattle populations were low (0.010 to 0.053). The expected heterozygosity was 0.827 and 0.916, respectively, for the Chihuahua and Tamaulipas populations. Both populations presented a heterozygote deficit: [Chihuahua FIS = 0.1 (p = 0.019) and Tamaulipas FIS = 0.317 (p < 0.001)]. In conclusion, this study showed that the Mexican Creole cattle have many low-frequency alleles, several of which are exclusive to these populations. Genetic distances obtained show that the Mexican Creole cattle population is composed of independent populations, far apart from other South American Creole populations.

Genetic polymorphism of the alpha s1-casein locus in five populations of goats from Mexico

With the objective of estimating allele frequencies, and testing for population divergence for the CSN1S1 locus, genotypes of animals from five goat populations; Saanen (n = 97), Alpine (n = 81) Toggenburg (n = 92), local goats with external appearance similar to the Murciana-Granadina breed from Central Mexico (n = 26) and heterogeneous local animals denominated Mosaico Lagunero (n = 30), from Northern Mexico, were identified using PCR and Xmn1 PCR-RFLP methodology. For Saanen, Alpine and Toggenburg, the sum of E and F alleles had the largest frequencies (from 0.468 to 0.789), while for the groups local Murciana-Granadina and Mosaico Lagunero the sum of the most frequent allelic groups (A and B), were 0.385 and 0.533 respectively. Both local Murciana-Granadina and Mosaico Lagunero populations showed heterozygote excess (P < 0.08). The percentage of the total genetic variation (F ST) explained by population differences was 5.16. There was genetic differentiation for most pair comparisons between populations (P < 0.05), excepting for Alpine versus Toggenburg, and Toggenburg versus Mosaico Lagunero (P > 0.05). For Saanen and Alpine the frequencies of alleles E and F were similar to the same breeds previously analyzed in Europe. Therefore there are opportunities of increasing the frequency of the strong alleles for protein content Gene Assisted Selection (GAS) in these two breeds. For Toggenburg the most frequent allelic groups were F (0.32) and B (0.21). Results indicate differentiation between most populations for this locus. Moreover, heterozygote excess in local populations indicated breed admixture.

Efecto del zeranol sobre la maduración de piel en chinchilla lanígera (Eryomis laniger) / Zeranol effect over chinchilla's (Eryomis laniger) fur maturation

Con el objeto de evaluar el efecto de la lactona del ácido resorcílico (zeranol) sobre la maduración de la piel de chinchilla, se realizó un experimento en un diseño completamente al azar por grupo de edad y sexo. El estudio duró 4 meses en la época de verano-otoño (junio-septiembre). Se incluyeron 33 hembras vírgenes de 12 a 24 meses de edad, 60 machos de 12 a 18 meses; y 29 hembras en producción de 24 a 48 meses de edad; a la mitad de los animales se les implantó subcutáneamente 12 mg de zeranol. La evaluación visual se hizo cada 2 semanas y se obtuvieron las pieles cuando las 3 franjas del color del pelo presentaban el mismo nivel en toda la superficie del cuerpo, momento en el cual se considera como piel madura. Se realizó un análisis de sobrevida mediante el método de Log Rank ajustado por grupos, en el cual se encontró un efecto anagénico significativo (P< 0.01) del zeranol. El porcentaje de maduración en los animales implantados fue 84 por ciento, 94 por ciento y 50 por ciento en los machos, hembras jóvenes y hembras adultas, respectivamente; mientras que para los no tratados la maduración fue de 20 por ciento, 38 por ciento y 13.3 por ciento, para los mismos grupos. Se hicieron dos análisis de Log Rank ajustado por grupos de tratamiento, los cuales mostraron un efecto de edad y sexo; en ambos casos las hembras jóvenes presentaron un mayor porcentaje de maduración que las hembras adultas y que los machos (P< 0.01)

Hacia un proyecto nacional e investigación en genomas de animales domésticos / Towards a national research genomic project on domestic animals

La investigación científica orientada a identificar, estudiar y aprovechar genes, así como a entender la organización y evolución del genoma, ha llevado a proyectos genómicos de gran escala como el Proyecto del Genoma Humano y de otros organismos de interés científico y económico para el hombre. En México es posible conformar este tipo de proyectos de forma original, con base en la extensa diversidad genética presente en poblaciones biológicas nativas que componen el patrimonio genómico nacional y utilizando diversos recursos disponibles en el dominio público. Los animales domésticos nativos en México contituyen un recurso genético valioso y único para identificar genes importantes para la industria pecuaria y la biotecnología. Sin embargo, estas variedades están amenazadas debido a las políticas de absorción y reemplazo por variedades comerciales mejoradas provenientes de países más desarrollados. La investigación genómica en animales domésticos puede ser importante para desarrollar y mantener una ganadería competitiva en una economía de mercado mundial. Por ello, se propone un proyecto genómico en animales domésticos en México cuyas metas serían: la preservación, estudio y la explotación de recursos genéticos autóctonos; la identificación, clonación y estudio de genes importantes desde el punto de vista comercial y médico, y la transferencia de tecnología a la industria animal local. Este proyecto puede ser el fundamento para estimular el desarrollo de una industria pecuaria nacional más moderna, competitiva e independiente, más adecuada a condiciones propias tanto ecológicas y económicas, como culturales y de mercado

Análisis genético del cociente producción de leche/perímetro torácico como indicador indirecto de la eficiencia en bovinos Holstein Friesian / Genetic analysis of milk yield/chest girth ratio as an indirect mesure of productive efficiency in Hosltein cows

El objetivo de este trabajo fue estudiar el cociente de producción de leche/perímetro torácico ajustado, considerándolo como un indicador aproximado de la eficiencia productiva lechera (ELA), a fin de incluirlos como criterio de selección en un programa de mejoramiento genético en ganado Holstein; con ese propósito se estimaron las varianzas y covarianzas aditivas utilizando el método de máxima verosimilitud restringida de la producción de leche ajustada a 305 días (PL) y ajustada a 305 días equivalente maduro (PEM), el perímetro torácico constante al momento del parto(PTA), el cociente PL/PTA (ELAAJ) y el cociente PEM/PTA (ELAEM). La heredailidad para PL, PEM, ELAAJ, ELAEM y PTA fue de 0.19 ñ 0.10, 0.27 ñ 0.11, 0.28 ñ 0.11, 0.64 ñ 0.14 y 0.25 ñ 0.11, respectivamente. Se estimaron las correlaciones fenotípicas y genéticas de las que sobresalen las correlaciones entre ELAAJ con PTA (-0.11 ñ 0.04 y -0.50 ñ 0.03), con PL (0.96 ñ 0.04 y 0.67 ñ 0.20) y con PEM (0.94 ñ 0.04 y 0.86 ñ 0.10), y PTA con PL (0.17 ñ 0.04 y 0.27 ñ 0.40). Se observaron valores inferiores en PTA equivalentes a 20 kg d peso vivo menos en el 10 por ciento superior de ELAAJ de las vacas de primer parto. Por ser ELAAJ una medida indirecta de la eficiencia muy simple, se concluye que su inclusión en los programas de selección del ganado Holstein presenta ventajas teóricas en la eficiencia, que aunque pequeñas, pudieran repercutir favorablemente en la economía de la empresa dedicada a la producción de leche

El factor de transferencia como biológico en la inmunoterapia de becerros lactantes clínicamente enfermos / Transfer factor immunotherapy in clinically sick lactating calves

Para evaluar el efecto del Factor de Transferencia (FT) en la respuesta leucocitaria en becerros clínicamente enfermos, se formaron tres grupos de diez animales cada uno. El grupo I (testigo) fue tratado con antibióticos, el II con FT más antibióticos y el III con la aplicación de tres dosis de FT (una cada tres días). Se tomaron muestras sanguíneas a todos los animales a los 0, 3, 5 y 14 días postratamiento, con el fin de realizar pruebas de Biometría Hemática y Rosetas "E" (para evaluar niveles de linfocitos "T"). Todos los animales se mantuvieron en observacióne durante 60 días (periodo de lactancia). Los resultados obtenidos fueron: El grupo I (testigo) tuvo un aumento de 3.87 porciento en la cuenta de roseras "E", el cual no fue significativo (P>0.05). Asimismo, los días de recuperación del cuadro clínico respiratorio (Neumonía) y digestivo (Síndrome Diarreico Neonatal, SDN), fueron de nueve para el primero de cinco para el segundo; existió un 20 porciento de mortalidad para este grupo. En el grupo II (FT + antibiótico) se encontró un aumento significativo (P<0.01) en la respuesta leucocitaria, dada por linfocitosis significativa (P<0.01); los días de recuperación fueron de ocho días con cuadro clinico respiratorio N y de cuatro con SDN, con mortalidad de 20 porciento. Los resultados obtenidos de laboratorio de los grupos II y III fueron semejantes, pues el aspecto clínico del grupo III y la recuperación de los animales fueron de cinco días para ambos cuadros clínicos y no hubo mortalidad.